Родился 16 февраля 1945 года на станции Агадырь Карагандинской области Казахской ССР в многодетной семье геологоразведчика.
В 1962 году переехал в Оренбург, где работал в геофизической экспедиции, а затем автослесарем в Управлении механизации треста «Оренбургпромстрой». После службы на Военно-морском флоте окончил Оренбургский политехнический институт.
В 1972 году был назначен директором Оренбургского предприятия объединённых котельных и тепловых сетей.
В 1973 году избран депутатом Оренбургского городского Совета народных депутатов. В 1976 году — первым заместителем председателя исполкома Оренбургского горсовета.
За многолетний добросовестный труд награждён медалью «За трудовое отличие» и орденом Дружбы народов.
В 1987 году поступил в Академию народного хозяйства при Совете Министров СССР, затем — в Высшую школу при Академии, по окончании которых был направлен в распоряжение Совета Министров Башкирии.
В августе 1989 году назначен на должность генерального директора совместного советско-британского предприятия в г. Уфе, в ноябре того же года — советником по внешнеэкономическим связям международного концерна «Восток».
С января 1991 года по сентябрь 2000 года возглавлял целый ряд крупных коммерческих предприятий и строительных организаций в Москве.
В 2000 году был избран на пост главы города Оренбурга, в 2004 году избран на второй срок.
С 2000 года по 2004 год являлся председателем Оренбургского городского Совета, с 2002 года по 2006 год — депутатом Законодательного собрания Оренбургской области III созыва (возглавлял комитет по вопросам бюджетной, налоговой, финансовой политики и внешнеэкономических связей).
В октябре 2010 года Ю. Н. Мищеряков избран депутатом Оренбургского городского Совета по единому избирательному округу. На первом заседании депутатов Оренбургского городского Совета большинством голосов избран Главой города Оренбурга в третий раз.
Имеет государственные награды: медаль «За трудовое отличие» (1974), орден Дружбы народов (1986), Орден Почета (2009). Удостоен многочисленных общественных наград, в числе которых высшая Российская общественная награда — золотой орден «Гордость России».
Лауреат Всероссийского конкурса «Лучший муниципальный служащий» (2002). В 2006 году по итогам Всероссийского конкурса «Лучшее муниципальное образование» Оренбург признан победителем по направлению «Экономика и финансы муниципального образования». Второй награды Минрегионразвития Ю. Н. Мищеряков удостоен как лучший глава муниципального образования Российской Федерации.
Звание Почётного гражданина города Оренбурга присвоено постановлением Оренбургского городского Совета от 26.01.2005 г. №7.
